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src/Makefile.in | 14 +++++-----
src/pisa/configure.ac | 67 +++++++++----------------------------------------
2 files changed, 19 insertions(+), 62 deletions(-)
diff --git a/src/Makefile.in b/src/Makefile.in
index 70781f3..b11db04 100755
--- a/src/Makefile.in
+++ b/src/Makefile.in
@@ -778,8 +778,8 @@ chainsaw : $(chainsawobjs)
eval $(CXX) $${mmdb_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -o chainsaw $(chainsawobjs) $(LDCXXFLAGS)
pdbcur.o pcur_funcs.o ncont.o coord_format.o pdb_merge.o chainsaw.o: # dependencies at end
@$(SETFLAGS) xxx=1 ; \
- echo $(CXX) -I$(mmdb_appdir) -I$(incdir) -I$(incdir)/mmdb $${mmdb_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(mmdb_appdir)/`basename $@ .o`.cpp ;
- eval $(CXX) -I$(mmdb_appdir) -I$(incdir) -I$(incdir)/mmdb $${mmdb_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(mmdb_appdir)/`basename $@ .o`.cpp
+ echo $(CXX) -I$(mmdb_appdir) -I$(incdir) `pkg-config --cflags mmdb` $${mmdb_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(mmdb_appdir)/`basename $@ .o`.cpp ;
+ eval $(CXX) -I$(mmdb_appdir) -I$(incdir) `pkg-config --cflags mmdb` $${mmdb_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(mmdb_appdir)/`basename $@ .o`.cpp
### bp3, afro, gcx
@@ -813,8 +813,8 @@ gcx : libbp3 $(gcxobjs)
$(libbp3objs) $(bp3objs) $(afroobjs) $(gcxobjs) : # dependencies at end
@$(SETFLAGS) xxx=1 ; \
- echo $(CXX) -I$(bp3dir) -I$(incdir) -I$(incdir)/mmdb $${bp3_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(bp3dir)/`basename $@ .o`.C ; \
- eval $(CXX) -I$(bp3dir) -I$(incdir) -I$(incdir)/mmdb $${bp3_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(bp3dir)/`basename $@ .o`.C
+ echo $(CXX) -I$(bp3dir) -I$(incdir) `pkg-config --cflags mmdb` $${bp3_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(bp3dir)/`basename $@ .o`.C ; \
+ eval $(CXX) -I$(bp3dir) -I$(incdir) `pkg-config --cflags mmdb` $${bp3_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(bp3dir)/`basename $@ .o`.C
### crunch2 pmf
@@ -853,7 +853,7 @@ cif2xml : $(cif2xmlobjs)
cross_validate : $(cross_validateobjs)
@$(SETFLAGS); rm -f cross_validate; eval $(CXX) $${harvest_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -o cross_validate $(cross_validateobjs) $(LDCXXFLAGS)
cif2xml.o cross_validate.o : # dependencies at end
- @$(SETFLAGS); eval $(CXX) -I$(harvest_appdir) -I$(incdir) -I$(incdir)/mmdb $${harvest_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(harvest_appdir)/`basename $@ .o`.cpp
+ @$(SETFLAGS); eval $(CXX) -I$(harvest_appdir) -I$(incdir) `pkg-config --cflags mmdb` $${harvest_app_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -c -o $@ $(harvest_appdir)/`basename $@ .o`.cpp
pdb_extractdir = $(srcdir)/harvest_app_/pdb_extract
pdb_extract_suite :
@@ -873,8 +873,8 @@ $(dev_tools_ctargets) :
$(dev_tools_cxxtargets) :
@$(SETFLAGS) xxx=1; \
rm -f $@; \
- echo $(CXX) $${dev_tools_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -o $@ $(dev_toolsdir)/$@.cpp -I$(incdir) -I$(incdir)/mmdb $(LDCXXFLAGS) ;\
- eval $(CXX) $${dev_tools_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -o $@ $(dev_toolsdir)/$@.cpp -I$(incdir) -I$(incdir)/mmdb $(LDCXXFLAGS)
+ echo $(CXX) $${dev_tools_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -o $@ $(dev_toolsdir)/$@.cpp -I$(incdir) `pkg-config --cflags mmdb` $(LDCXXFLAGS) ;\
+ eval $(CXX) $${dev_tools_FLAGS-"$(CXXFLAGS)"} -o $@ $(dev_toolsdir)/$@.cpp -I$(incdir) `pkg-config --cflags mmdb` $(LDCXXFLAGS)
### mlphare
mlphare:
diff --git a/src/pisa/configure.ac b/src/pisa/configure.ac
index 81afdda..044b6f8 100755
--- a/src/pisa/configure.ac
+++ b/src/pisa/configure.ac
@@ -31,64 +31,21 @@ AC_CHECK_FUNCS([floor pow rint sqrt])
# test for function in m
AC_CHECK_LIB([m], [sqrt])
-dnl Optional: Check for MMDB.
-AM_PATH_MMDB(,
- [ if test "x$mmdb_prefix" != x ; then
- if test "x$ac_MMDB_CXXFLAGS" != x && test "x$ac_MMDB_LDOPTS" = x ; then
- case "$ac_MMDB_CXXFLAGS" in
- *src/mmdb )
- ac_MMDB_LDOPTS=`echo "$ac_MMDB_CXXFLAGS" | sed s#src/mmdb#src#g`
- ;;
- *include/mmdb )
- ac_MMDB_LDOPTS=`echo "$ac_MMDB_CXXFLAGS" | sed s#include/mmdb#lib#g`
- ;;
- *)
- esac
- MMDB_CXXFLAGS="$ac_MMDB_CXXFLAGS"
- MMDB_LIBS=`echo "$ac_MMDB_LDOPTS -lmmdb" | sed s#-I#-L#`
- AC_MSG_WARN([assuming library $MMDB_LIBS headers $MMDB_CXXFLAGS])
- else
- MMDB_CXXFLAGS="-I$mmdb_prefix/src -I$mmdb_prefix/src/mmdb -I$mmdb_prefix/include -I$mmdb_prefix/include/mmdb"
- MMDB_LIBS="-L$mmdb_prefix/src -L$mmdb_prefix/lib -lmmdb"
- AC_MSG_WARN([assuming library $MMDB_LIBS headers $MMDB_CXXFLAGS])
- fi
- else
- AC_MSG_ERROR([mmdb not found])
- fi
- ]
-)
+PKG_CHECK_MODULES([MMDB],[mmdb])
+PKG_CHECK_MODULES([SSM],[ssm])
+
+MMDB_CXXFLAGS=${MMDB_CFLAGS}
+
+AC_SUBST([MMDB_CFLAGS])
+AC_SUBST([MMDB_CXXFLAGS])
+AC_SUBST([SSM_CFLAGS])
+
+AC_SUBST([MMDB_LIBS])
+AC_SUBST([SSM_LIBS])
-ac_saved_CXXFLAGS=$CXXFLAGS
-ac_saved_LIBS=$LIBS
CXXFLAGS="$CXXFLAGS $MMDB_CXXFLAGS"
LIBS="$MMDB_LIBS $LIBS"
-AM_PATH_SSM(,
- [ if test "x$ssm_prefix" != x ; then
- if test "x$ac_SSM_CXXFLAGS" != x && test "x$ac_SSM_LDOPTS" = x ; then
- case "$ac_SSM_CXXFLAGS" in
- *lib/ssm )
- ac_SSM_LDOPTS=`echo "$ac_SSM_CXXFLAGS" | sed s#lib/ssm#lib#g`
- ;;
- *include/ssm )
- ac_SSM_LDOPTS=`echo "$ac_SSM_CXXFLAGS" | sed s#include/ssm#lib#g`
- ;;
- *)
- esac
- SSM_CXXFLAGS="$ac_SSM_CXXFLAGS"
- SSM_LIBS=`echo "$ac_SSM_LDOPTS -lssm" | sed s#-I#-L#`
- AC_MSG_WARN([assuming library $SSM_LIBS headers $SSM_CXXFLAGS])
- else
- SSM_CXXFLAGS="-I$ssm_prefix/include/ssm -I$ssm_prefix/lib/ssm"
- SSM_LIBS="-L$ssm_prefix/lib -L$ssm_prefix/lib/ssm -lssm"
- AC_MSG_WARN([assuming library $SSM_LIBS headers $SSM_CXXFLAGS])
- fi
- else
- AC_MSG_ERROR([ssm not found])
- fi
- ]
-)
-CXXFLAGS=$ac_saved_CXXFLAGS
-LIBS=$ac_saved_LIBS
+
# Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
#
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