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Fix build system to honour user flags.
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -1,10 +1,4 @@
-hello !!!
-
-CC = gcc #cc
-CFLAGS = -O4 -fomit-frame-pointer -Wall -static
-# CFLAGS = -Wall
-# CFLAGS = -g -Wall
-# CFLAGS = -pg -Wall -fprofile-arcs -static
+CC ?= gcc
LIBS = -lm
PROG = PHYML
@@ -23,39 +17,39 @@
$(EXEC) : $(OBJS)
- $(CC) -o $(EXEC) $(OBJS) $(LIBS) $(CFLAGS)
+ $(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) -o $(EXEC) $(OBJS) $(LIBS)
clean :
@rm *.o
######################################################################################################
eigen.o : eigen.c eigen.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c eigen.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c eigen.c
simu.o : simu.c simu.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c simu.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c simu.c
lk.o : lk.c lk.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c lk.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c lk.c
utilities.o : utilities.c utilities.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c utilities.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c utilities.c
optimiz.o : optimiz.c optimiz.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c optimiz.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c optimiz.c
bionj.o : bionj.c bionj.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c bionj.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c bionj.c
main.o : main.c
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c main.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c main.c
models.o : models.c models.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c models.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c models.c
free.o : free.c free.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c free.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c free.c
options.o : options.c options.h
- $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) -c options.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(DFLAG) $(CPPFLAGS) -c options.c
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